Univerzitet Crne Gore je organizovan kao i većina evropskih univerziteta. Univerzitetom upravlja Upravni odbor, a rukovodi rektor.

Najviše akademsko tijelo je Senat Univerziteta.

 

Rektorat je centralna upravljačka cjelina na Univerzitetu Crne Gore. Čine ga: rektor, prorektori, generalni sekretar, rukovodilac finansija i odgovarajuće stručne službe.

 

Univerzitet Crne Gore u svom sastavu ima fakultete, samostalne studijske programe, akademiju i institute, kao organizacione jedinice. U sastav Univerziteta Crne Gore spadaju 19 fakulteta, tri instituta i tri samostalna studijska programa.

 

Fakultetima rukovode dekani, a institutima direktori. Na fakultetima, odnosno institutima najviša akademska tijela su nastavno-naučna, odnosno nastavno-umjetnička vijeća.

Nastava se organizuje u 10 gradova Crne Gore - u Podgorici (32 studijska programa),  Nikšiću (18 studijskih programa), Kotoru  (6 studijskih programa), u Bijelom Polju (3 studijska programa),  Beranama  (3 studijska programa), Budvi  (2 studijska programa), Pljevljima  (1  studijski program), u Herceg-Novom i Baru (po 1 studijski program) i na Cetinju (17 studijskih programa).

 

Ukupan broj studenata na Univerzitetu je 20475.

 

Najviše tijelo studenata je Studentski parlament. Predstavnici studenata biraju se i u sve organe Univerziteta i fakulteta.